纯化水设备的消毒大体上可分为物理消毒和化学消毒两种。紫外线消毒可能只会对局部有作用，除菌过滤器可能只发回临时的作用。在纯化水设备中，不论是巴氏消毒、过热水灭菌或纯蒸汽灭菌，都被认为是较为常规的物理消毒。臭氧、过氧化氢、次氯酸等均是常用的化学消毒剂。在本文中，简单为大家介绍几种消毒体例。
一、巴氏消毒法：在纯化水水设备中，巴氏消毒重要功能是：
1.于纯化水设备的活性炭等预处理单元。
2.RO/EDI单元以及储存与分配管网单元的周期性消毒。巴氏消毒法也称低温消毒法，它的一种能杀死各种病原菌的热处理方法，其对象重要是病原微生物及其他生长态菌。
巴氏消毒的工作原理是，行使病原体不是很耐热的特点，用适当的温度和保温时间处理，将其悉数杀灭。但是经过巴氏消毒后，仍保存小部分较耐热的细菌或细菌芽孢。因此巴氏消毒不是无菌处理过程。
二、紫外线消毒法：在纯化水设备中，紫外线消毒装置重要安装于纯化水设备的RO/EDI循环管路及储存与分配管网循环管路，以防止系统中微生物指标的过快增加。充足剂量下，紫外辐射是一种有用的消毒体例。紫外线消毒的原理较为复杂，一样平常认为它与对生物体内代谢、遗传、变异等征象起着决定性作用的核酸相关。紫外线的强度、紫外线光谱波长和辐射时间是紫外线消毒结果的决定性因素。
三、臭氧消毒法：臭氧是一种广为谱遍的杀菌剂，通过氧化作用破坏微生物膜的结构而达到杀菌结果，可以有用杀灭细菌滋生体、芽孢、病毒和真菌等，并可破坏肉毒杆菌毒素。在纯化水设备中，臭氧消毒可用于纯化水、高纯水的储存与分配系统的消毒。
在纯化水设备中可用到的消毒体例还有化学消毒法，蒸汽消毒法等。合理的选择消毒体例，可有用的控制和降低纯化水设备中微生物负荷
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